Společný regionální operační program obsahuje čtyři priority. Každá priorita je rozdělena na opatření, případně podopatření:
Priorita 1. Regionální podpora podnikání
- 1.1 Podpora podnikání v regionech
Priorita 2. Regionální rozvoj infrastruktury
- 2.1 Rozvoj dopravy v regionech
- 2.1.1 Rozvoj regionální dopravní infrastruktury
- 2.1.2 Rozvoj dopravní obslužnosti v regionech
- 2.2 Rozvoj informačních a komunikačních technologií v regionech
- 2.3 Regenerace a revitalizace vybraných měst
Priorita 3. Rozvoj lidských zdrojů v regionech
- 3.1 Infrastruktura pro rozvoj lidských zdrojů v regionech
- 3.2 Podpora sociální integrace v regionech
- 3.3 Posílení kapacity místních a regionálních orgánů
Priorita 4. Rozvoj cestovního ruchu
- 4.1 Rozvoj služeb pro cestovní ruch
- 4.1.1 Podpora nadregionálních služeb cestovního ruchu
- 4.1.2 Podpora místních a regionálních služeb cestovního ruchu
- 4.2 Rozvoj infrastruktury pro cestovní ruch
- 4.2.1 Podpora nadregionální infrastruktury cestovního ruchu
- 4.2.2 Podpora místní a regionální infrastruktury cestovního ruchu